Nuevo preprint sobre nuestro proyecto colaborativo enfocado en el estudio del arroz maleza Argentino16/10/2023 ¡Tenemos preprint nuevo! Este trabajo colaborativo con título "Adaptive introgression from local cultivars is a driver of agricultural adaptation in Argentinian weedy rice" es súper relevante para nuestro país y es tan pero tan lindo que acá va un pequeño resúmen de lo que encontramos. Muchas de las malezas agrícolas están cercanamente emparentadas con los cultivos que acompañan. En Argentina y para el cultivo de arroz, está el 'arroz maleza' (o 'arroz rojo' como la llaman por los pagos arroceros). El arroz maleza tiene una alta incidencia en toda la región productora de arroz Argentina, pero poco sabemos (o sabíamos) sobre su diversidad, estructura poblacional y origen. ¡Entonces junto con Ale Presotto y María Crepy nos pusimos manos a la obra! Usando una colección de ~100 biotipos de toda la región productora, estudiamos variabilidad en caracteres morfológicos fisiológicos y fenológicos. Vimos un enorme rango de variación en todos los caracteres medidos! En la figura va de ejemplo caracteres de semilla. Multiple Correspondence Analysis on seven qualitative phenotypic traits. Plots showing the clustering of 103 Argentinian weedy rice (AWR) and eight varieties cult ivated in Argentina on A: dimensions (Dim) 1 and 2 and B: dimensions 3 and 4. The arrows represent the variables with a significant effect on cultivars and weedy rice distribution, C: variability in hull color and awn presence on Argentinian weedy rice. Seeds without hulls on the left showing the red pericarps over a one cm-long black line. Haciendo GBS (15K SNPs) y comparando con data disponible online de arroces maleza y cultivares de la región y el mundo, determinamos que las malezas Argentinas se agrupan con los tipos indica y aus. Pero eso no es todo, los arroces maleza de Argentina, Brasil y Uruguay son muy cercanos entre si y a los de EEUU, predominantemente tipo aus o híbridos aus-indica. Sin embargo, la ancestría tipo aus en cultivares de Argentina y Brasil no es común. ¿Y entonces? Esto nos lleva a dos hipótesis: 1) introducción por medio de semilla no certificada desde EEUU, o 2) dedomesticación a partir de cultivares con ancestría aus. La primera es más probable dada la historia del cultivo de arroz en el país. ¿Y qué pasa con los híbridos? El arroz maleza aus se cruzó con cultivares indica de la región, y surgieron los híbridos. Éstos se expandieron rápidamente gracias a la presión de selección impuesta por herbicidas en los últimos ~20 años con la comercialización de cultivares IMI-resistentes.
Aún tenemos mucho para indagar sobre esta maleza tan pero tan interesante que afecta profundamente la productividad del cultivo de arroz, conocer sus características nos acerca varios pasos a poder mejorar su control y bajar los costos de producción para los productores. En el trabajo colaboramos gente de CERZOS (CONICET-UNS), INTA (EEA Corrientes, Concepción del Uruguay, IABIMO) y la Universidad de Massachussets con financiamiento de Agencia I+D+i, CONICET, INTA, Fulbright Program, y NSF.
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Esta segunda parte del año se sumaron al PEMlab Franco Gomez Dominguez, Sofía Sanchez y Tomás Blanzaco, los tres estudiantes de Ingeniería en Agrobiotecnología de la UNSAM. Franco estará realizando su trabajo final de carrera (tesina) indagando sobre potenciales mecanismos que median los efectos transgeneracionales usando Arabidopsis thaliana como modelo. Sofía y Tomás, aprovechando su semestre de cursdada en el INTA Castelar, estarán realizando una pasantía y aprendiendo sobre cuidado de plantas de Arabidopsis y arroz, crecimiento en condiciones controladas y de campo, recolección y análisis de datos, ¡y mucho más! Gracias por elegirnos :)
No se pierdan de chequear nuestra nuevo review recientemente publicado sobre la memoria de las plantas que analiza las implicancias eco-evo, las múltiples redes moleculares involucradas y su potencial para predecir las respuestas de las plantas en el contexto del cambio climático. ¡Pueden leer el artículo OA siguiendo este enlace! Además, miren la publicación del blog de Botany One aquí.
En Junio de este año, nos hemos mudado a nuestro nuevo hogar en el Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (IABIMO), instituto de doble dependencia INTA-CONICET. Estamos muy contentos de poder contar con acceso a nuevos recursos e infraestructura para acompañar nuestro crecimiento como grupo que además nos permitan contestar preguntas nuevas y más ambiciosas. Estamos sumamente agradecidos al iB3, nuestra primera casa, ya que nos permitió comenzar a explorar hipótesis de trabajo relacionadas a la biología de plantas.
Luego de unos meses de incertidumbre, CONICET le ha otorgado una beca doctoral a Cruz Ferrer Vieyra, quien recientemente se graduó con una excelente defensa de tesina. Su trabajo de tesis evaluará la variación fenotípica de la colección de arroz maleza, enfocado en caracteres del sistema radical, e indagará sobre las comunidades del suelo asociadas a las malezas y cultivos (junto con la genia de Eva Figuerola, iB3-FCEN-UBA). ¡Estamos muy contentxs de que Cruz pueda quedarse trabajando con nosotrxs!
En Abril y Diciembre, nuestros estudiantes de grado Tomás Deguer y Cruz Ferrer Vieyra defendieron exitosamente sus tesinas de grado con calificación sobresaliente, ¡felicitaciones a ambos! Estamos muy orgullosxs de sus logros.
Les damos la bienvenida a les estudiantes de licenciatura Aldana Gomez (Biotecnología, UNQ) y Cruz Ferrer Vieyra (Biología, UBA) quienes se sumaron al grupo para trabajar en diferentes proyectos. Aldana estará trabajando codo a codo con Isabella tratando de desenmascarar los secretos del arroz maleza mediante el análisis de los datos recolectados en la campaña 2020-21. Cruz estará empezando una línea completamente nueva de trabajo en el laboratorio y se adentrará en el estudio del desarrollo de raíces en plántulas. Si quieren saber más sobre ellos pueden seguir este link.
El día viernes 26 de marzo, la estudiante Clara Fontana defendió su tesina de licenciatura titulada "Rol de la vía RdDM en la expresión de los efectos transgeneracionales de temperatura en semillas de Arabidopsis thaliana". Los jurados Paula Fernández, Jorge Muschietti y Federico Ariel aprobaron la tesina y su defensa con calificación sobresaliente. La tesina fue realizada bajo un contexto mundial desafiante, contó con el apoyo de muchas personas que nos ayudaron a resolver cosas durante la cuarentena y con las ganas inagotables de Clara. ¡Felicitaciones Clara!
La licenciada Fontana se queda trabajando en el grupo para comenzar su doctorado estudiando la variación natural asociada a los efectos transgeneracionales gracias a la adjudicación de una beca CONICET. Estamos muy contentos de compartir que Clara Fontana e Isabella Rampoldi han recibido becas CONICET que les otorga financiación por 5 años a partir de Abril de 2021 para realizar sus tesis doctorales estudiando diferentes aspectos de las respuestas transgeneracionales a ambientes de generaciones anteriores. Clara estará trabajando en el iB3 (FCEN-UBA) explorando la variación natural a nivel genético y epigenético asociada a los efectos maternos en plantas de Arabidopsis thalianaI. Isabella estará trabajando en la EEA Concepción del Uruguay (INTA) en Entre Ríos codo a codo con nuestra colaboradora y amiga María Crepy en el proyecto que llevamos a cabo junto con ella y Alejandro Presotto para entender las implicancias de los efectos transgeneracionales en ecosistemas agropecuarios, enfocándonos en las respuestas del arroz maleza.
¡Felicitamos a ambas por este logro y les damos una fuerte bienvenida! El 29 de Octubre Gabriela estuvo hablando sobre biología de plantas para el ciclo de encuentros virtuales para chicxs curiosxs "Científicxs Van a Casa". ¡Les dejamos el video! |
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Escribimos sobre cosas que nos llaman la atención, experiencias, artículos interesantes (propios y ajenos), experimentos y noticias del laboratorio. Archivo
Octubre 2023
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